1.IDC机房建设是一个复杂而关键的问题。为了确保合规，稳妥的方法是选择像联通、电信、移动等基础运营商的机房。这些机房都经过了相关部委的安全检测，因此，业务服务器和系统评测服务器部署在其中运营是完全没有问题的。然而，有些企业为了节省投入，可能会选择价格低廉的第三方机房。这时，就需要企业或相关服务机构帮助企业把好关，确认这些机房是否合规，是否已经通过安全评测。否则，很容易导致机房费用已经缴纳，但企业的信安系统却无法通过评测，许可证拿不到手，正常的业务也无法开展。
2. IDC从业市场存在一定的不稳定性。由于政策的原因，IDC市场处于完全封闭状态，外部资本基本无法进入。因此，一些企业通过收购和并购原有IDC企业从事IDC业务，甚至有些企业处于无证经营的状态，这给市场监管带来了不利因素。
3. IDC市场并不适合小的IDC企业。原有IDC企业将面临三方面的挑战。首先，新兴IDC企业对原有IDC市场的冲击可能导致市场份额的流失。其次，工信部将对原有IDC/ISP牌照的企业进行整治和清理，这可能会给企业带来运营风险。z后，工信部将引入数据中心评级和IDC企业信誉评价体系，这使得一批规模较小、技术薄弱、竞争力弱的IDC企业势必将被淘汰。
4. IDC许可证办理成功后，可能出现对接脱节现象。很多企业在办理成功IDC许可证后，就认为可以正常运营了。然而，实际上，企业开展业务所需用到的备案管理系统、信息安全管理系统必须完成与通信管理局和工信部部系统的对接才可以。因此，企业在获得许可证后仍需关注与相关系统的对接问题，确保业务的顺利进行。